北京市南水北調配套工程總體規劃立足科學發展觀，圍繞以南水北調來水的合理、高效利用，確保城市供水安全的目標，做好供需水預測與《南水北調工程總體規劃》、《北京城市總體規劃（2004年-2020年）》、《北京市水資源綜合規劃》、北京市“十一五”專項規劃，配套工程規劃方案與國家批復的中線干線北京段工程方案，外調水供水系統與本地水供水系統等三個銜接，力求實現水資源的最優調度。